개정 전 : 국어, 도덕, 사회, 수학, 과학, 체육, 음악, 미술, 실과 9과목
개정 후 : 필수과목 -> 국어, 사회, 수학, 과학 4과목
          선택과목 -> 도덕, 음악, 미술, 실과, 체육, 영어 중 2과목

※ 2006년 중학교입학자격검정고시 시험부터는 기존의 9과목에서 필수 4과목 및 선택 2과목(총6과목)으로 3과목 축소되어 시행됨

※ (과목합격자의 성적처리에 관한 경과조치)
  이 규칙 시행 전 도덕, 음악, 미술, 실과 체육과목 중 3과목 이상 합격한 자는 종전에 과목 합격한 점수와 당해 고시에서 취득한 점수를 모두 합산하여 고시성적을 산출하되 이는 2008년도 고시까지만 적용함

※ 과목합격자 성적 산출 방법
 예) 2004년 도덕, 음악, 미술, 실과 4과목 합격한 경우 성적 합산방법은 도덕, 음악, 미술,
실과 4과목 취득점수와 필수 4과목 응시하여 취득한 점수를 합한 후 나누기 8과목 하여 평균 60점 이상이면 합격 처리됨

※ 2005년 도덕, 음악 2과목 과목 합격한 경우 성적 합산 방법은 도덕, 음악 2과목 취득점수와
필수 4과목 응시하여취득한 점수를 합한 후 나누기 6과목으로 하여 평균 60점이상이면 합격 처리됨